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1、中圖分類號Q坌三窆UDC579碩士學(xué)位論文學(xué)校代碼!Q三三密級公玨基因指紋用于23株嗜酸氧化亞鐵硫桿菌菌株親緣性研究GeneticFingerprinttoStudyRelatednessofAcidithiobacillusferrooxidansStrains作者姓名:學(xué)科專業(yè):研究方向:學(xué)院(系、所):指導(dǎo)教師:范宏偉生物工程微生物冶金資源加工與生物工程學(xué)院吳學(xué)玲副教授論文答辯日期型蘭:莖三三答辯委員會中南大學(xué)二。一三年五月基因指
2、紋技術(shù)用于23株嗜酸氧化亞鐵硫桿菌菌株親緣性研究摘要:嗜酸氧化亞鐵硫桿菌作為一種重要的微生物冶金細(xì)菌,在世界生物冶金領(lǐng)域內(nèi)都有著廣泛的應(yīng)用。雖然嗜酸氧化亞鐵硫桿菌已經(jīng)得到深入的研究,但是由于其特性,難以分離純化,且種內(nèi)菌株難以用傳統(tǒng)方法快速鑒別。本文研究了嗜酸氧化亞鐵硫桿菌菌株對銅離子的最大耐受能力,并將其按表型進行分類。結(jié)果顯示,菌株的銅離子耐受能力從60mmol/L至200mmol/L,菌株問的差異較大。嗜酸氧化亞鐵硫桿菌菌株耐受能
3、力從高到低依次為DY26、DY30、DY32、GF、BY01、BY0502、GDA、GDB、GD9、DXS、DYl5、DYl8、JYC2、JYC3、DX5、YTW、JYC1、BY03、DC、GD0。銅離子耐受能力較高的菌株從高到低為DY26、DY30、DY32、GF、By01、BY0502、GDA、GDB、GD9、DXS、DYl5、DYl8、JYC2、JYC3,最大銅離子耐受濃度為200160mmol/L;耐受能力較低的菌株從高到低為D
4、X5、YTW、JYC1、BY03、DC、GD0,最大銅離子耐受濃度為120—60mmol/L。為研究23株嗜酸氧化亞鐵硫桿菌菌株的基因多樣性,以及基因指紋技術(shù)分類與其表型特性的相關(guān)性,使用40種RAPD(randomamplificationofpolymorphicDNA)引物,通過PCR擴增23株菌株的基因組DNA,產(chǎn)物凝膠電泳并使用紫外成像系統(tǒng)成像,并分析所得條帶的有無,從而使用Jaccard系數(shù)和UPGMA分析菌株間親緣相關(guān)性。
5、實驗共得到了518個不同長度的可重復(fù)條帶,所有40種隨機引物進行的RAPD實驗結(jié)果中,23株菌種間相似系數(shù)最小為428%,而相似系數(shù)最大為921%。OPC組引物能產(chǎn)生更多的特異基因指紋,并在嗜酸氧化亞鐵硫桿菌種內(nèi)擁有更強的分類鑒定能力。銅離子耐受能力較高的14株菌株中,相似系數(shù)最高為914%(DY26與DY30),相似系數(shù)最低為612%(BY01與BY0502),銅離子耐受能力較低的6株菌株中,相似系數(shù)最高為888%(DX5與DC),而
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