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文檔簡介
1、生物信息學(xué)是一門交叉學(xué)科,是應(yīng)用信息科學(xué)的理論、方法和技術(shù)來管理、分析和利用生物分子數(shù)據(jù)。通過收集、組織、管理生物分子數(shù)據(jù),使研究人員獲得或者方便地使用相關(guān)信息。生物信息學(xué)以計算機,網(wǎng)絡(luò)為工具,采用數(shù)學(xué)和信息科學(xué)的理論、方法和技術(shù)去研究生物大分子,其研究重點主要落實在核酸和蛋白質(zhì)兩個方面,包括它們的序列、結(jié)構(gòu)和功能。 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測是生物信息學(xué)研究中的重要課題之一。而蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測中的重要組成部分,能為蛋白質(zhì)
2、的空間結(jié)構(gòu)預(yù)測提供許多結(jié)構(gòu)信息。在基于機器學(xué)習(xí)的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法中,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測方法一直是一個研究熱點,該方法提高了預(yù)測準(zhǔn)確率,但是也存在著以下的問題:對當(dāng)前位置的殘基預(yù)測無法引入序列遠(yuǎn)距離信息。改進的預(yù)測方法是首先進行多序列比對找到待測蛋白質(zhì)序列的同源信息作為輸入信息,這樣的改進是基于已知的家族蛋白質(zhì)進行的。毫無疑問還有很多不屬于任何家族的未知蛋白質(zhì),因此基于全局比對的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法也不能完全解決以上的問題。 本文從上面提到的
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