水貂產(chǎn)仔性狀相關(guān)基因及遺傳多樣性研究.pdf

1、水貂是我國部分地區(qū)飼養(yǎng)的主要特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)物，水貂的產(chǎn)仔數(shù)是一個(gè)重要的經(jīng)濟(jì)性狀，產(chǎn)仔數(shù)的提高將大大增加水貂年存欄量，給養(yǎng)貂業(yè)帶來巨大的經(jīng)濟(jì)效益。因此，有效地提高水貂的產(chǎn)仔數(shù)是水貂育種的主要目標(biāo)之一。運(yùn)用現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)來研究這一品種產(chǎn)仔性狀的分子遺傳機(jī)制，對(duì)水貂的品種選育工作具有十分重要的意義。 本研究選擇ESR、FSHβ、FSHR、PRLR四個(gè)基因作為候選基因，采用克隆測序結(jié)合PCR-SSCP的方法，檢測了這些基因的部分編碼區(qū)的

2、SNPs，并分析了突變位點(diǎn)導(dǎo)致的多態(tài)性與產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)之間的相關(guān)性。 隨著水貂飼養(yǎng)業(yè)的大力發(fā)展，一些彩色水貂品種相繼出現(xiàn)，但關(guān)于彩色水貂與標(biāo)準(zhǔn)黑褐色水貂之間遺傳關(guān)系的研究，至今無人報(bào)道。為了揭示水貂品種內(nèi)和品種間的遺傳關(guān)系，本研究采集了標(biāo)準(zhǔn)黑褐色水貂、藍(lán)寶石貂、咖啡色貂3個(gè)品種的89個(gè)樣本，應(yīng)用RAMP標(biāo)記對(duì)這3個(gè)品種的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析。本論文主要研究結(jié)果如下： (1)分別檢測了ESR基因外顯子1和外顯子7。在外顯子

3、1處發(fā)現(xiàn)了一個(gè)突變位點(diǎn)產(chǎn)生了3種基因型，突變位點(diǎn)為G256C，該突變導(dǎo)致編碼氨基酸甘氨酸到丙氨酸的改變，屬于錯(cuò)義突變。在ESR基因外顯子7處檢測到2種基因型。 (2)在ESR基因外顯子1上，在所檢測的水貂群體中，A等位基因有利于母貂的產(chǎn)仔數(shù)。在ESR基因外顯子7處，檢測到的2種基因型對(duì)產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)的影響差異都不顯著。 (3)對(duì)FSHβ基因外顯子3的檢測表明，該處存在一個(gè)突變位點(diǎn)，即C75T，該突變導(dǎo)致編碼氨基酸脯氨酸

4、到亮氨酸的改變，C75T突變導(dǎo)致的三種基因型對(duì)產(chǎn)仔數(shù)性狀的影響接近顯著水平(P=0.0516)。 (4)在FSHR基因外顯子10處檢測到一個(gè)突變位點(diǎn)A741C，這一突變并未導(dǎo)致編碼氨基酸的改變。這一突變產(chǎn)生的三種基因型對(duì)水貂產(chǎn)活仔數(shù)的影響有顯著的趨勢。 (5)在PRLR基因的外顯子2和外顯予10處，并未檢測到SSCP多態(tài)性。 (6)在RAMP標(biāo)記分析中，從240個(gè)引物組合中篩選出14個(gè)引物組合對(duì)標(biāo)準(zhǔn)黑褐色水貂、藍(lán)

5、寶石貂、咖啡色貂3個(gè)品種的89個(gè)樣本進(jìn)行了擴(kuò)增。共擴(kuò)增出81條DNA片段，75條具有多態(tài)性，多態(tài)百分率為92.59％，每個(gè)引物組合可擴(kuò)增4～8條多態(tài)性條帶，平均5.78條。遺傳相似系數(shù)變化范圍為0.3469～0.9796，平均值為0.610。聚類分析顯示，RAMP標(biāo)記能將供試材料區(qū)分開。多態(tài)條帶比率、Shannon多樣性指數(shù)以及Nei基因多樣性指數(shù)(h)均顯示水貂與彩貂品種間較為豐富的遺傳多樣性。采用Nei遺傳距離、Shannon多樣性