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1、植物特異的Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor(TCP)轉(zhuǎn)錄因子家族,其功能涉及調(diào)控細(xì)胞生殖與細(xì)胞分化,且在植物生長和發(fā)育過程中的許多方面具有重要作用。然而,目前針對TCP轉(zhuǎn)錄因子家族的研究在辣椒中未見報道。
本文利用生物信息學(xué)方法對辣椒TCP轉(zhuǎn)錄因子家族成員、基因分類、基因結(jié)構(gòu)、染色體定位、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系和結(jié)構(gòu)域序列保守性進(jìn)行了預(yù)測和分析。結(jié)果表明,辣椒
2、TCP基因家族包含30個成員,CaTCP蛋白含有95~550個氨基酸,等電點為6.30~10.91。進(jìn)化樹分析將其分為11個不同的亞族。辣椒TCP家族進(jìn)化樹以及基因結(jié)構(gòu)的進(jìn)一步分析顯示辣椒TCP家族可分為兩大類,即ClassⅠ類和ClassⅡ類,而ClassⅡ類可分為兩個不同的亞類,即CIN和CYC/TB1亞類。位于同一亞家族的大多數(shù)TCP基因具有相似的內(nèi)含子和外顯子結(jié)構(gòu)。此外,染色體定位分析表明辣椒TCP基因不均衡的分布于辣椒的10條
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