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文檔簡介
1、山東農業(yè)大學碩士學位論文暗色絲孢真菌細基格孢屬(Ulocladium)、匍柄霉屬(Stemphylium)及鏈格孢屬(Alternaria)的分類和分子系統(tǒng)學研究姓名:薛峰申請學位級別:碩士專業(yè):生物化學與分子生物學指導教師:王漢忠張修國20050520山東農業(yè)大學碩士研究生畢業(yè)論文摘要分子系統(tǒng)發(fā)育分析是生物信息學中的一種基本方法,用于研究生物在分子水平的進化式樣、方向、速率以及各種分子機制對基因和基因組的結構與功能的影響。分子系統(tǒng)學研
2、究的一個主要目標是根據(jù)分子數(shù)據(jù)構建系統(tǒng)發(fā)育樹,進而推斷某一特定類群系統(tǒng)發(fā)育的分支式樣。現(xiàn)已發(fā)展起來的系統(tǒng)樹構建方法主要有筒約法(parsimonymethod)、相容法(compatibilitymethod)、距離矩陣法(distancematrixmethod)和最大似然性法(maximumlikelihoodmethod)等。本研究利用PAUP’軟件中的簡約法(parsimonymethod)和鄰近結合距離法(neighborjo
3、iningmethod)對植物致病性真菌細基格孢屬(Ulocladium)、匍柄霉屬(Stemphylium)及鏈格孢屬(Alternaria)的典型菌種進行了分子系統(tǒng)發(fā)育分析,探索出一套基于基因序列同源性比較分析的分子系統(tǒng)學研究方法,修訂了該類群真菌現(xiàn)代分類系統(tǒng)并分析其屬內種間和相似屬間遺傳演化的關系。同時將形態(tài)分類和分子系統(tǒng)學技術相結合應用于該類群真菌的進一步分類研究上,分離并定義新菌種。在本校植物病理學系真菌資源研究室前期研究工作
4、基礎上繼續(xù)廣泛收集來自我國境內不同寄主(基質)、地理分布和生境的細基格孢屬(Ulocladium)、匍柄霉屬(Stemphylium)和鏈格孢屬(ABernaria)的菌株,從四川、重慶、貴州、云南、山東等5個省市采集的1200多份標本中分離到8個細基格孢屬(Ulocladium),64個匍柄霉屬(Stemphylium)菌株鑒定并描述了兩個新種,辣椒細基格孢Ulocladiumcapsicum和亞小球匍柄霉Stemphyliumsub
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