水稻直立穗基因的精細(xì)定位和候選基因的分析.pdf

1、水稻是重要的糧食作物，也是人們研究禾本科植物的模式植物。水稻基因組測序完成后，為水稻基因功能的研究提供了便利。利用水稻突變體作為研究基因功能的材料，對發(fā)現(xiàn)和鑒定基因的功能具有重要的意義。在本實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)初步定位的基礎(chǔ)上，對水稻直立穗基因進(jìn)行精細(xì)定位和候選基因分析，主要結(jié)果如下：
　　 1、基于水稻直立穗基因被初步定位在第7號染色體的長臂上的兩個(gè)SSR標(biāo)記RM505和RM429之間。通過自行設(shè)計(jì)引物來尋找與目的基因遺傳距離更近的分子

2、標(biāo)記。實(shí)驗(yàn)最終得到的2個(gè)與直立穗基因緊密連鎖的分子標(biāo)記EP03和EP09，它們與目的基因的遺傳距離都為0.153cM，并且得到一個(gè)共分離標(biāo)記EP15。
　　 2、依據(jù)水稻基因組數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站(http://www.gramene.org/Multi/blastview/)提供的信息，通過對水稻第7號染色體全基因組序列的搜索，EP03和EP09標(biāo)記在水稻第7號染色體長臂上的位置分別為：(+)25377599～25377616，(-)2

3、5377683～25377700和(+)25416005～25416023，(-)25416146～25416164，兩者之間的物理距離約為38.41kb。
　　 3、根據(jù)EP03和EP09標(biāo)記的位置，確定EP03和EP09在水稻第7號染色體長臂上的區(qū)間為25377599～25416164。由此在水稻基因組數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站(http://rice.plantbiology.msu.edu/cgi-bin/gbrowse/rice/?r