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文檔簡介
1、文昌魚是現(xiàn)存的與脊椎動物原始祖先最接近的頭索動物,一直被認(rèn)為是研究脊椎動物起源和進(jìn)化的模式動物。文昌魚的基因序列和表達(dá)模式已經(jīng)被廣泛用于不同物種之間的比較基因組學(xué)研究和發(fā)育同源性分析。本文從青島文昌魚(Branchiostoma belcheri tsingtaunese)腸cDNA文庫中,克隆了具有完整編碼框的胞質(zhì)蛋白promethin-like基因,并對其結(jié)構(gòu)、定位、進(jìn)化和表達(dá)進(jìn)行了研究,并首次嘗試其功能的探索。 首先,從青
2、島文昌魚消化道cDNA文庫中克隆了全長為1014bp的文昌魚promethin-like cDNA,最大開放閱讀框編碼167個氨基酸的蛋白質(zhì),理論分子量為18 kDa,該cDNA編碼的蛋白還沒有明確的保守結(jié)構(gòu)域,這點與已報道的人和鼠的promethin相似。文昌魚promethin-like和哺乳動物、鳥類和兩棲類的promethin序列同源性相近(20-29%),沒有明顯差異。通過構(gòu)建promethin蛋白家族系統(tǒng)進(jìn)化樹分析可知,青島
3、文昌魚位于脊椎動物基部,這與脊索動物是脊椎動物的祖先的觀點相一致。TMHMM Server v.2.0軟件分析結(jié)果顯示,文昌魚promethin-Like為跨膜蛋白,且與人、鼠、蛙等脊椎動物相同,都具有3個跨膜區(qū)域。上述分析表明,文昌魚promethin-like可能代表了脊椎動物promethin的原型,且約5.5億年前脊椎動物和無脊椎動物從共同祖先分化以后,包括人在內(nèi)的脊椎動物promethin變異不大。 其次,Northe
4、rn結(jié)果顯示,promethin-like在文昌魚肝盲囊、后腸、鰓、精巢、卵巢組織中的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為一條帶,大小為1014bp。切片原位雜交分析表明,promethin-like在成體文昌魚組織中呈特異性表達(dá),在鰓、肝盲囊和后腸表達(dá)量較高,在卵巢、精巢、神經(jīng)管中的表達(dá)量較低,與Northern結(jié)果基本一致。切片原位雜交以及Northern結(jié)果也提示我們,文昌魚promethin-like和哺乳動物promethin組織表達(dá)相似,即可能在體內(nèi)
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