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文檔簡介
1、環(huán)介導等溫擴增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技術是一種新穎的核酸擴增技術,該技術以其靈敏度高、特異性強、反應速度快、檢測成本低等優(yōu)點已廣泛應用于各種病原體的檢測,但在環(huán)境污染監(jiān)測方面的應用則較少。
本文以我國海洋經(jīng)濟魚類褐菖鲉(Sebastiscus marmoratus)為研究對象,克隆了四種熱休克蛋白(heat shock proteins,HSPs)——HS
2、P60、HSC70、HSP70和HSP90基因序列,分別建立并優(yōu)化定量LAMP技術。為驗證定量LAMP技術的可行性,將褐菖鲉分別暴露于20μg·L-1、60μg·L-1和180μg·L-1原油水溶性成分(water soluble fraction,WSF),第1、5、10d采樣,利用定量LAMP技術檢測肝HSPs基因的表達情況,并與Real-time PCR結果進行比較。
主要研究結果如下:
(1)建立了H
3、SPs的LAMP檢測方法,并對其中的幾個重要參數(shù)進行了優(yōu)化。結果表明,Mg2+最佳濃度為8 mmol·L-1,外引物與內引物濃度比為1:6時效果最好,最適反應溫度為64℃,最佳反應時間為50 min,甜菜堿最佳濃度為0.4mol·L-1,dNTP最佳濃度為1.4 mmol·L-1。
(2)本實驗以HNB為染料,建立了定量LAMP檢測技術,對其靈敏度進行摸索發(fā)現(xiàn),檢測限為4.74×104 copies,而Real-time
4、PCR的檢測限為2.75 copies。雖然LAMP的靈敏度低于Real-time PCR,但是LAMP反應快,成本低,耗時短,只需簡易的實驗設備,更適用于現(xiàn)場的快速檢測。
(3)原油WSF短期毒性實驗結果表明,LAMP的檢測結果與Real-time PCR的基本一致,表明該方法可用于實際樣品的快速檢測;不同濃度原油WSF暴露下,不同HSPs基因mRNA的表達變化趨勢不一致,其中對WSF敏感性和特異性較好的是HSP60和H
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