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文檔簡介
1、與核苷酸序列相關(guān)的特征關(guān)鍵詞表與核苷酸序列相關(guān)的特征關(guān)鍵詞表丙氨酸丙氨酸AlanineAlanineA或AlaAla89.07989.079CHCH3脂肪族類脂肪族類精氨酸精氨酸ArginineArginineR或ArgArg174.188174.188HN=C(NHHN=C(NH2)NH(CH)NH(CH2)3堿性氨基酸堿性氨基酸類天冬酰胺天冬酰胺AsparagineAsparagineN或AsnAsn132.104132.104H2
2、NCOCHNCOCH2酰胺類酰胺類天冬氨酸天冬氨酸AsparticAsparticacidacidD或AspAsp133.089133.089HOOCCHHOOCCH2酸性氨基酸酸性氨基酸類半胱氨酸半胱氨酸CysteineCysteineC或CysCys121.145121.145HSCHHSCH2含硫類含硫類谷氨酰胺谷氨酰胺GlutamineGlutamineQ或GlnGln146.131146.131H2NCO(CHNCO(CH2)
3、2酰胺類酰胺類谷氨酸谷氨酸GlutamicGlutamicacidacidE或GluGlu147.116147.116HOOC(CHHOOC(CH2)2酸性氨基酸酸性氨基酸類甘氨酸甘氨酸GlycineGlycineG或GlyGly75.05275.052HH脂肪族類脂肪族類組氨酸組氨酸HistidineHistidineH或HisHis155.141155.141N=CHNHCH=CCHN=CHNHCH=CCH2|__________|
4、|__________|堿性氨基酸堿性氨基酸類異亮氨酸異亮氨酸IsoleucineIsoleucineI或IleIle131.160131.160CHCH3CHCH2CH(CHCH(CH3))脂肪族類脂肪族類亮氨酸亮氨酸LeucineLeucineL或LeuLeu131.160131.160(CH(CH3)2CHCHCHCH2脂肪族類脂肪族類賴氨酸賴氨酸LysineLysineK或LysLys146.17146.17H2N(CHN(CH
5、2)4堿性氨基酸堿性氨基酸類蛋氨酸蛋氨酸MethionineMethionineM或MetMet149.199149.199CHCH3S(CHS(CH2)2含硫類含硫類苯丙氨酸苯丙氨酸PhenylalaniPhenylalanineneF或PhePhe165.177165.177PhenylCHPhenylCH2芳香族類芳香族類脯氨酸脯氨酸ProlineProlineP或ProPro115.117115.117N(CHN(CH2)3CH
6、CH|_________||_________|亞氨基酸亞氨基酸絲氨酸絲氨酸SerineSerineS或SerSer105.078105.078HOCHHOCH2羥基類羥基類蘇氨酸蘇氨酸ThreonineThreonineT或ThrThr119.105119.105CHCH3CH(OH)CH(OH)羥基類羥基類色氨酸色氨酸TryptophanTryptophanW或TrpTrp204.213204.213PhenylNHCH=CCHPh
7、enylNHCH=CCH2|___________||___________|芳香族類芳香族類酪氨酸酪氨酸TyrosineTyrosineY或TyrTyr181.176181.1764OHPhenylCH4OHPhenylCH2芳香族類芳香族類纈氨酸纈氨酸ValineValineV或ValVal117.133117.133CHCH3CH(CHCH(CH2))脂肪族類脂肪族類CDSCDSsig_peptidetransit__sig_pe
8、ptidetransit____peptidemat_peptideintronpolyA_site__peptidemat_peptideintronpolyA_siterRNAtRNAscRNArRNAtRNAscRNA和snRNA)snRNA)限定的任何轉(zhuǎn)錄本或限定的任何轉(zhuǎn)錄本或RNARNA產(chǎn)物產(chǎn)物misc_signamisc_signal含有控制或改變基因功能或表達之信號的任何區(qū)域含有控制或改變基因功能或表達之信號的任何區(qū)域所述
9、信號不能用其他所述信號不能用其他SignalSignal關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞(promoterCAAT_signalTATA_signal(promoterCAAT_signalTATA_signal35_signal10_signalGC_signalRBSpolyA_signalenhancerattenuatt35_signal10_signalGC_signalRBSpolyA_signalenhancerattenuattermina
10、terminat和rep_igin)rep_igin)表述表述misc_strucmisc_structureture不能用其他不能用其他StructureStructure關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞(stem_loop(stem_loop和Dloop)Dloop)表述的任何二級或三級結(jié)表述的任何二級或三級結(jié)構(gòu)或構(gòu)象構(gòu)或構(gòu)象modified_bmodified_basease被指示的核苷酸是經(jīng)修飾的核苷酸被指示的核苷酸是經(jīng)修飾的核苷酸并應(yīng)由被指示的分
11、子并應(yīng)由被指示的分子(在mod_basemod_base修飾詞修飾詞意義中給出意義中給出)所取代所取代mRNAmRNA信使信使RNARNA;包括;包括55非翻譯區(qū)非翻譯區(qū)(5UTR)(5UTR),編碼序列,編碼序列(CDS(CDS,外顯子,外顯子)和3和3非翻譯區(qū)非翻譯區(qū)(3(3UTRUTR)mutationmutation在此位置處,相關(guān)品系的序列中具有突然的,可遺傳的變化在此位置處,相關(guān)品系的序列中具有突然的,可遺傳的變化N_reg
12、ionN_region在重排的免疫球蛋白區(qū)段之間插入的額外的核苷酸在重排的免疫球蛋白區(qū)段之間插入的額外的核苷酸Old_sequenOld_sequencece在此位置處,所表述的序列修改了此序列以前的版本在此位置處,所表述的序列修改了此序列以前的版本PolyA_signPolyA_signalal聚腺苷酸化之后內(nèi)切核酸酶裂解聚腺苷酸化之后內(nèi)切核酸酶裂解RNARNA轉(zhuǎn)錄本所必需的識別區(qū)域;共有序列轉(zhuǎn)錄本所必需的識別區(qū)域;共有序列=AATA
13、AAAATAAAPolyA_sitePolyA_siteRNARNA轉(zhuǎn)錄本上的位點轉(zhuǎn)錄本上的位點通過轉(zhuǎn)錄后聚腺苷酸化該位點將被加上腺嘌呤殘基通過轉(zhuǎn)錄后聚腺苷酸化該位點將被加上腺嘌呤殘基Precurs_Precurs_RNARNA仍不是成熟的仍不是成熟的RNARNA產(chǎn)物的任何產(chǎn)物的任何RNARNA種類;可包括種類;可包括55剪切區(qū)剪切區(qū)(5clip)(5clip),55非翻譯非翻譯區(qū)(5UTR)(5UTR),編碼序列,編碼序列(CDS(C
14、DS,外顯子,外顯子),間插序列(內(nèi)含子),間插序列(內(nèi)含子),33非翻譯區(qū)非翻譯區(qū)(3UTR3UTR)和33剪切區(qū)剪切區(qū)(3clip)(3clip)prim_transprim_transcriptcript初級(最初的,未加工的)轉(zhuǎn)錄本;包括5初級(最初的,未加工的)轉(zhuǎn)錄本;包括5剪切區(qū)(5剪切區(qū)(5clipclip)5非翻譯區(qū)非翻譯區(qū)(5(5UTRUTR)編碼序列編碼序列(CDS(CDS外顯子外顯子))間插序列間插序列(內(nèi)含子內(nèi)含
15、子)3)3非翻譯區(qū)非翻譯區(qū)(3UTR)(3UTR)和33剪切區(qū)剪切區(qū)(3clip)(3clip)prim_bindprim_bind起始復(fù)制起始復(fù)制轉(zhuǎn)錄或逆轉(zhuǎn)錄的非-共價的引物結(jié)合位點轉(zhuǎn)錄或逆轉(zhuǎn)錄的非-共價的引物結(jié)合位點包括合成的例如包括合成的例如PCRPCR引物引物元件的位點元件的位點PromoterPromoter參與參與RNARNA聚合酶的結(jié)合以啟動轉(zhuǎn)錄的聚合酶的結(jié)合以啟動轉(zhuǎn)錄的DNADNA分子區(qū)域分子區(qū)域protein_bipr
16、otein_bindnd核酸上非-共價的蛋白質(zhì)結(jié)合位點核酸上非-共價的蛋白質(zhì)結(jié)合位點RBSRBS核糖體結(jié)合位點核糖體結(jié)合位點repeat_regrepeat_regionion含有重復(fù)單位的基因組區(qū)域含有重復(fù)單位的基因組區(qū)域repeat_unirepeat_unit單個重復(fù)元件單個重復(fù)元件rep_iginrep_igin復(fù)制起點復(fù)制起點復(fù)制核酸以得到兩個相同拷貝的起始位點復(fù)制核酸以得到兩個相同拷貝的起始位點RRNARRNA成熟的核糖體成
17、熟的核糖體RNARNA;將氨基酸裝配成蛋白質(zhì)的核糖核蛋白顆粒(核糖體)中的;將氨基酸裝配成蛋白質(zhì)的核糖核蛋白顆粒(核糖體)中的RNARNA成份成份S_regionS_region免疫球蛋白重鏈的開關(guān)區(qū);它參與重鏈免疫球蛋白重鏈的開關(guān)區(qū);它參與重鏈DNADNA的重排的重排導(dǎo)致來自相同導(dǎo)致來自相同B-細胞的不-細胞的不同免疫球蛋白類的表達同免疫球蛋白類的表達SatelliteSatellite短的基本重復(fù)單位的很多串聯(lián)重復(fù)短的基本重復(fù)單位的
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