國家自然基金標書-蛋白質組海量質譜數(shù)據(jù)的解析及其在人類基因組注釋中的應用

1、項目名稱： 蛋白質組海量質譜數(shù)據(jù)的解析及其 蛋白質組海量質譜數(shù)據(jù)的解析及其在人類基因組注釋中的應用 在人類基因組注釋中的應用首席科學家： 劉斯奇 劉斯奇 中國科學院北京基因組研究 中國科學院北京基因組研究所起止年限： 2010 2010 年 1 月-2014 -2014 年 8 月依托部門： 中國科學院 中國科學院采用 De Novo 方法獨立演繹所測定肽段的氨基酸順序，進一步反轉肽段信息至基因組，試圖補充和修訂基因組的蛋白質編碼基因

2、，具體研究：? 構建綜合性蛋白質序列數(shù)據(jù)庫；? 建立基于肽段信息注釋基因組的方法流程；? 利用 MS/MS 所鑒定的肽段補充和修訂基因組蛋白質編碼基因。3．基于高精度質譜數(shù)據(jù)的蛋白質表達譜 基于高精度質譜數(shù)據(jù)的蛋白質表達譜定量計算方法的研究及應用 定量計算方法的研究及應用以鑒定的肽段頻率為基礎，發(fā)展兼顧準確度與規(guī)?；姆菢擞浂康鞍踪|學方法，同時開發(fā)以多肽質譜數(shù)據(jù)為基礎的蛋白質編碼基因的可視化標識技術，實現(xiàn)蛋白質表達譜的定量化，具

3、體研究：? 蛋白質表達譜定量算法研究；? 蛋白質組表達譜定量分析及可視化研究；? 建立以基因為中心的定量蛋白質數(shù)據(jù)庫及分析平臺。4． 基于質譜數(shù)據(jù)的預測結論的實驗驗證研究 基于質譜數(shù)據(jù)的預測結論的實驗驗證研究運用質譜學、生物化學、分子生物學和免疫學等手段系統(tǒng)驗證基于 MS/MS 數(shù)據(jù)所分析的生物信息學結論，同時為生物信息學的理論模型提供嚴格設計和控制的實驗數(shù)據(jù)，具體研究：? 建立先進的MRM技術平臺實現(xiàn)對蛋白質定性和定量的高通量