基于幾何特征的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)相似性研究.pdf

1、蛋白質(zhì)功能與其空間結(jié)構(gòu)密切相關(guān)。蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)相似性研究對(duì)蛋白質(zhì)功能預(yù)測(cè)具有重要意義,因此己成為領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)問(wèn)題之一。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)相似性研究通常從物理、化學(xué)、幾何或混合的角度進(jìn)行研究。幾何特征是描述蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的重要因素。本文從蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)劃分模式及統(tǒng)計(jì)方法、結(jié)構(gòu)的多尺度特征、結(jié)構(gòu)分布的幾何特性等方面對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的相似性開(kāi)展了相關(guān)研究。主要工作如下:
　　 (1)對(duì)扇形劃分的特征提取方法進(jìn)行深入研究,進(jìn)一步考慮了扇形內(nèi)部表面點(diǎn)的

2、分布及分布一致性問(wèn)題,在此基礎(chǔ)上采用基于統(tǒng)計(jì)的方法改進(jìn)了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)扇形劃分模型的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)相似性比較方法。實(shí)驗(yàn)表明所提出方法的分類(lèi)準(zhǔn)確率優(yōu)于點(diǎn)個(gè)數(shù)特征提取方法,由此體現(xiàn)了扇形內(nèi)部分布所對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)對(duì)分類(lèi)的意義,并初步證實(shí)了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的多尺度特性。
　　 (2)研究了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)特征的多尺度問(wèn)題。提出了一個(gè)基于小波變換的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多尺度的相似性比較方法。該方法首先把蛋白質(zhì)映射到一維空間,然后應(yīng)用小波變換實(shí)現(xiàn)結(jié)構(gòu)的多尺度分解,