中國(guó)女性全基因組拷貝數(shù)變異與初潮年齡的關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、初潮年齡(AAM)是由基因因素和環(huán)境因素共同影響的復(fù)雜性狀。初潮是指青春期女生的第一次月經(jīng)，通常發(fā)生在11歲至16歲之間。初潮是女生青春期的一個(gè)重要標(biāo)志。青春期的發(fā)育年齡對(duì)個(gè)體在今后的生活上有很大的影響，包括對(duì)自身的，對(duì)社會(huì)的，也有對(duì)心理文化上的。由于青春期發(fā)育年齡很難準(zhǔn)確界定，通常使用AAM來(lái)對(duì)其年齡早晚進(jìn)行指示。AAM是許多病癥的風(fēng)險(xiǎn)因子，例如憂郁癥，精神障礙，骨質(zhì)疏松癥以及乳腺癌。當(dāng)今有一些全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定出一些與Adam有關(guān)

2、聯(lián)的基因和單核苷酸多態(tài)性(SNPs)。然而，這些方法得到的潛在基因還只是滄海一粟，這促使我們進(jìn)一步尋找那些仍未被發(fā)現(xiàn)的，但對(duì)AAM有貢獻(xiàn)率的遺傳變異。隨著現(xiàn)在拷貝數(shù)變異關(guān)聯(lián)研究已經(jīng)成為鑒定遺傳基因位點(diǎn)的熱潮，并且還沒有關(guān)于初潮年齡表型與全基因組拷貝數(shù)變異的關(guān)聯(lián)研究，因此這篇文章的主要目的是填補(bǔ)國(guó)內(nèi)外這一學(xué)術(shù)空白。
　　 拷貝數(shù)變異(CNV)是基因變異的一種類型，片段大小從1kb至數(shù)Mb不等。而拷貝數(shù)多態(tài)性(CNP)是指頻率大于1

3、％的CNV。CNV已經(jīng)被證明是與某些人類復(fù)雜疾病相關(guān)聯(lián)的。CNV在基因表達(dá)的總變異中比例占到20％。在正常健康的個(gè)體中，CNV在基因組中的廣泛分布意味著CNV可能是表型多樣性的一種驅(qū)動(dòng)力。最近，我們實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行了骨質(zhì)疏松癥的全基因組拷貝數(shù)關(guān)聯(lián)研究，并且鑒定出兩個(gè)新的候選基因，UGT2817和VPS13B。然而，至今還沒有關(guān)于CNVs和AAM之間的關(guān)聯(lián)研究，拷貝數(shù)變異對(duì)AAM所起的作用還不清楚。此研究中，我們?cè)?25個(gè)中國(guó)漢族女性人群中做了

4、關(guān)于AAM的全基因組拷貝數(shù)變異的關(guān)聯(lián)研究。研究采用Affymetrix GeneChip Human Mapping SNP6．0的芯片，并隨后在1728個(gè)美國(guó)白種人中對(duì)顯著的結(jié)果進(jìn)行了重復(fù)驗(yàn)證。我們發(fā)現(xiàn)位于染色體4q21．1的CNP10744在中國(guó)和美國(guó)人群中都達(dá)到顯著水平，p值分別為0．017和0．010。在CNP10744區(qū)域有三個(gè)相關(guān)聯(lián)的基因，淋巴細(xì)胞趨化因子(CXCL13)，細(xì)胞周期蛋白G2(CCNG2)，細(xì)胞周期蛋白I(CC