A-FABP基因多態(tài)性與雞生長(zhǎng)和體組成性狀的關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、A-FABP（Adipocyte fatty acid binding protein，也稱aP2）即脂肪型脂肪酸結(jié)合蛋白是脂肪酸結(jié)合蛋白家族（FABPs）之一，該家族還包括心臟型（H-）、腦型（B-）、髓磷脂型（M-）、表皮型（E-）、回腸型（IL-）、肝臟型（L-）、睪丸型（T-）、小腸型（I-）脂肪酸結(jié)合蛋白。FABPs被認(rèn)為是運(yùn)輸細(xì)胞內(nèi)脂肪酸非常重要的蛋白，它們可以增加脂肪酸的溶解性并將脂肪酸從脂膜運(yùn)輸?shù)街舅嵫趸奈恢茫ň€粒體

2、，過氧化物酶體）、脂肪酸脂化成甘油三酯或磷脂的位置，或者進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi)發(fā)揮其可能的調(diào)控功能。FABPs在脂質(zhì)代謝的調(diào)節(jié)上起到了重要的作用。
　　 國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)雞A-FABP基因外顯子或內(nèi)含子區(qū)進(jìn)行了少數(shù)變異位點(diǎn)的多態(tài)性研究，結(jié)果表明在一些品種中變異位點(diǎn)對(duì)腹脂性狀有顯著的影響。本研究將進(jìn)行多位點(diǎn)檢測(cè)，并且在檢測(cè)外顯子同時(shí)，將檢測(cè)區(qū)域擴(kuò)展到5’-調(diào)控區(qū)及3'-調(diào)控區(qū)，以期對(duì)A-FABP基因進(jìn)行全面研究。選用肉雞高、低脂雙向選擇品系第十

3、世代雞群、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)F2資源群體、AA肉雞隨機(jī)群體為試驗(yàn)材料，采用測(cè)序、PCR.RFLP、PCR-L、DHPLC的方法進(jìn)行基因多態(tài)性檢測(cè)和個(gè)體基因型分析，通過各多態(tài)位點(diǎn)間的連鎖不平衡分析選擇標(biāo)簽SNP并構(gòu)建單倍型，進(jìn)而利用單位點(diǎn)不同基因型和不同單倍型分別與雞生長(zhǎng)和體組成性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，旨在探A-FABP基因多態(tài)性對(duì)雞生長(zhǎng)和體組成性狀的影響。主要研究結(jié)果如下：
　　 （1）以東北農(nóng)業(yè)大學(xué)肉雞高、低脂雙向選擇品系第十世代雞群為試

4、驗(yàn)材料，通過測(cè)序、PCR-RFLP、PCR-LP、DHPLC的方法在A-FABP基因上共檢測(cè)到8個(gè)突變位點(diǎn)，其中5’-調(diào)控區(qū)檢測(cè)到5個(gè)突變位點(diǎn)，分別是g.-1376 G>A、g.-1117 C>T、g.-972_-963 del10、g.-846_-845 ins22、g.-415_-409 del7；外顯子1、外顯子3及3’-調(diào)控區(qū)各檢測(cè)到1個(gè)突變位點(diǎn)，分別是g.51 C>T、g.1729 G>A、g.3163 T>C。連鎖不平衡分析

5、表明，g.-1376 G>A、g.-1117 C>T、g.-972_-963 del10、g.-846_-845 ins22處于強(qiáng)連鎖狀態(tài)，位于一個(gè)單倍型塊中，g.-415_-409 del7與g.51 C>T、g.1729 G>A處于第二個(gè)單倍型塊中。g.-1376G>A、g.-1117C>T、g.-972_-963 del10、g.-415_-409del7、g.3163T>C為標(biāo)簽SNPs。以NEAU-F2資源群體為試驗(yàn)材料，進(jìn)行

6、連鎖不平衡分析，發(fā)現(xiàn)g.-972_-963 del10、g.-846_-845 ins22、g.51 C>T、g.1729 G>A處于強(qiáng)連鎖狀態(tài)，位于一個(gè)單倍型塊中。g.-846_-845 ins22、g.1729 G>A為標(biāo)簽SNPs。
　　 （2）以東北農(nóng)業(yè)大學(xué)肉雞高、低脂雙向選擇品系第十世代雞群為試驗(yàn)材料，對(duì)A-FABP基因的8個(gè)突變位點(diǎn)（g.-1376 G>A、g.-1117 C>T、g.-972_-963 del10、

7、g.-846_-845 ins22、g.-415_-409 del7、g.51 C>T、g.1729 G>A、g.3163 T>c）進(jìn)行基因型檢測(cè)。將產(chǎn)生的不同基因型在高、低脂系第十世代雞群進(jìn)行基因型頻率分析及等位基因頻率分析，并對(duì)等位基因頻率進(jìn)行卡方獨(dú)立性檢驗(yàn)（x2）。結(jié)果表明，基因型頻率在高脂系和低脂系中分布差異很大，尤其是g.-415_-409 del7位點(diǎn)，僅有9個(gè)Ⅱ基因型。等位基因頻率分析表明除g.-1117 C>T、g.-9

8、72_-963del10外，其它6個(gè)多態(tài)位點(diǎn)等位基因頻率在十世代兩系間存在極顯著差異（P<0.01）。
　　 （3）以東北農(nóng)業(yè)大學(xué)肉雞高、低脂雙向選擇品系第十世代雞群為試驗(yàn)材料，進(jìn)行8個(gè)單位點(diǎn)及4種單倍型與雞生長(zhǎng)和體組成性狀的相關(guān)分析。兩方面結(jié)果表明不同基因型和單倍型對(duì)肌胃重、肌胃率有顯著影響；以NEAU-F2資源群體為試驗(yàn)材料，進(jìn)行4個(gè)單位點(diǎn)及4種單倍型與雞生長(zhǎng)和體組成性狀的相關(guān)分析，結(jié)果表明不同基因型和單倍型對(duì)雞6周齡體重、

9、12周跖長(zhǎng)、脾臟比率、肌胃重、肌胃比率、跖爪重有顯著影響（P<0，05），對(duì)龍骨長(zhǎng)、股骨長(zhǎng)、小胸肌重、小胸肌率有極顯著影響（P<0.01）。以AA肉雞隨機(jī)群體為試驗(yàn)材料，進(jìn)行2個(gè)單位點(diǎn)與雞生長(zhǎng)和體組成性狀的相關(guān)分析，結(jié)果表明g.-972_-963 del10異位點(diǎn)不同基因型對(duì)所有性狀均無(wú)顯著影響（P>0.05）：g.-846_-845 ins22變異位點(diǎn)不同基因型對(duì)雞5周齡體重、脾臟重有顯著影響（p<0.05），對(duì)其它性狀均無(wú)顯著影響（